Avis d’appel à candidature pour la Bourse doctorale Marie Curie (H/F) : Identifier et caractériser les éléments spécifiques à la régénération chez Nematostella vectensis, France

Description du sujet de thèse

Une bourse de doctorat de 3 ans en biologie régénérative est disponible à l’Institut de recherche sur le cancer et le vieillissement de Nice (IRCAN), en France. La bourse fait partie du réseau doctoral REGENERATE-IT, financé par l’Action Marie-Sklodowska-Curie (MSCA).

L’objectif du projet est d’identifier et de déterminer le rôle des processus cellulaires et des gènes spécifiques à la régénération chez l’anémone de mer Nematostella vectensis (https://tinyurl.com/Nematostella). Ils ont été identifiés lors d’une comparaison bio-informatique RNA-seq à grande échelle comparant l’embryogenèse et la régénération qui a révélé des gènes avec une dynamique d’expression spécifique à la régénération et plus globalement, une logique de réseau de régulation des gènes spécifique à la régénération (https://tinyurl.com/NvRegGRN ). Le scRNA-seq, bulk/scATAC-seq et des bulkARN-seq complémentaires en cours fourniront une version plus définie du GRN de régénération avec une résolution tissulaire et cellulaire. Ensemble avec nos découvertes récentes que les mésentères (structures internes de l’animal) jouent un rôle crucial dans l’induction du processus de régénération de Nematostella via l’activation de deux populations de cellules souches distinctes (https://tinyurl.com/NvStemCells), cela nous offre une occasion unique d’acquérir un aperçu mécanistique de la fonction de gènes / voies sélectionnés. Ainsi, dans ce projet, nous tirerons parti de la richesse des données tissulaires, cellulaires et moléculaires caractérisant la régénération de Nematostella et utiliserons des approches d’édition du génome de pointe pour étudier i) la fonction des gènes, ii) les éléments régulateurs et iii) le destin cellulaire.

Le boursier recevra une formation en soins animaliers, en micro-injections, en biologie cellulaire, moléculaire, en développement d’outils moléculaires et génétiques ainsi qu’en analyses phénotypiques via des approches d’imagerie et/ou -omiques de pointe du laboratoire d’accueil, dans le cadre du projet de recherche, ainsi que des formations en biologie régénérative dans le cadre du réseau doctoral REGENERATE-IT. La formation sera adaptée aux besoins du boursier et du projet sélectionné (voir ci-dessus).

Cette bourse impliquera des périodes de formation/recherche dans les laboratoires d’autres partenaires de REGENERATE-IT et la participation à des réunions annuelles et des écoles d’été organisées par le réseau, afin de tirer pleinement parti du large éventail d’expertises disponibles dans le réseau. Le boursier aura la possibilité de développer des compétences en présentation, en rédaction et autres compétences transférables, et de participer à des activités de sensibilisation. Plus d’informations sur les activités de formation sont disponibles sur le site web du projet www.regenerate-it.eu

 

Contexte de travail

Le.a candidate recruté.e rejoindra l’équipe réponse au stress, régénération et longévité dirigée par le Dr Eric Röttinger à l’Institut de recherche sur le cancer et le vieillissement de Nice (IRCAN) qui fait partie de la faculté de médecine de Nice. L’IRCAN est affilié au CNRS, à l’INSERM et à l’Université Côte d’Azur. Le candidat retenu sera inscrit en tant que doctorant à l’Université Côte d’Azur et fera partie de la communauté internationale et interdisciplinaire du réseau doctoral REGENERATE-IT, financé par l’Action Marie-Sklodowska-Curie (MSCA) – www.regenerate-it.eu

L’équipe Röttinger s’inspire des caractéristiques biologiques intrigantes des cnidaires (coraux, anémones de mer, méduses), telles que leur haute résistance au stress (ex. irradiance, privation de nourriture), leurs capacités de régénération extrêmes, ainsi que leur longévité prolongée. À l’aide d’expertises complémentaires, des approches et plateformes technologiques à la pointe de l’état d’art, les principales recherches de notre équipe interdisciplinaire visent à : A) Caractériser les mécanismes tissulaires, cellulaires et moléculaires qui sous-tendent la régénération du corps entier des cnidaires. B) Comprendre les bases cellulaires, moléculaires et génétiques de l’adaptation aux variations environnementales et de la réponse au stress des cnidaires. C) Déterminer comment les cnidaires préviennent le vieillissement et les maladies associées au vieillissement. Plus d’informations : www.ircan.org/en/research/eric-rottinger

Le réseau doctoral REGENERATE-IT (MSCA action de l’UE) rassemble un éventail complet de disciplines – de la recherche fondamentale à la recherche appliquée – pour former la prochaine génération de chercheurs en biologie régénérative et dans les domaines adjacents. Il s’agit d’un consortium de chercheurs de haut niveau issus de diverses universités, instituts de recherche et entreprises couvrant 12 établissements universitaires dans 10 pays européens (Pays-Bas, France, Belgique, Autriche, Suède, Allemagne, Italie, Danemark, Suisse et Royaume-Uni). Les compétences disponibles dans le réseau REGENERATE-IT sont encore élargies par l’implication d’un bénéficiaire non universitaire, de quatre organisations partenaires industrielles, d’un cabinet de conseil en brevets, d’un organisme de recherche à but non lucratif, d’un éditeur scientifique, d’un groupe de défense des patients et de Women Organisation d’un réseau de scientifiques. Le consortium REGENERATE-IT propose 12 postes de doctorat entièrement financés pour travailler avec des chercheurs européens de premier plan afin de faire avancer les frontières de la biologie et de la médecine régénératives. De plus amples informations sur tous les projets sont disponibles sur le site Web du projet www.regenerate-it.eu.

A propos de l’Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement de Nice (IRCAN). Le vieillissement est généralement perçu comme un processus qui résulte de l’influence conjuguée de facteurs constitutionnels ou dits « génétiques », de facteurs liés au mode de vie et d’événements extérieurs. La compréhension de ces multiples interconnexions nécessite une synergie entre de nombreux domaines de la biologie moléculaire, cellulaire ou biomédicale, plus dédiés à l’étude du vieillissement et des maladies liées à l’âge comme le cancer. Dans ce but, l’IRCAN a été créé par l’Université Côte d’Azur (UCA), l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (INSERM) et le Centre national de la recherche scientifique (CNRS). L’IRCAN est situé à la Faculté de Médecine à proximité immédiate du Centre Hospitalier Universitaire (CHU). Les recherches menées à l’IRCAN concernent les grands domaines de la biologie, de la recherche fondamentale aux applications médicales. Le vieillissement est généralement perçu comme un processus qui résulte de l’influence conjuguée de facteurs constitutionnels ou dits « génétiques », de facteurs liés au mode de vie et d’événements extérieurs. La compréhension de ces multiples interconnexions nécessite une synergie entre de nombreux domaines de la biologie ou de la biologie expérimentale moléculaire, cellulaire ou biomédicale, plus dédiée à l’étude du vieillissement et des maladies liées à l’âge comme le cancer. Dans ce but, les recherches menées à l’IRCAN mobilisent les grands domaines de la biologie, de la recherche fondamentale aux applications médicales, avec pour objectifs d’améliorer notre compréhension du socle commun entre vieillissement et cancer ainsi que de développer des stratégies innovantes pour étendre notre santé- portée. Plus d’informations : www.ircan.org/en/about-the-ircan/presentation.

 

Contraintes et risques

N/A

 

Informations complémentaires

Nous recherchons un chercheur fortement motivé, enthousiaste et créatif avec les qualifications, compétences et expertises suivantes :

Qualifications requises :

•  Master en sciences (obtenu avant la date de début), de préférence en biosciences moléculaires (biologie moléculaire, cellulaire et du développement, génétique ou génomique). Les étudiants fortement motivés d’autres disciplines sont également encouragés à postuler ;
•  Preuve d’une communication courante en anglais (oral/écrit) ;
•  Faire preuve de rigueur scientifique, de sens de l’organisation et de l’esprit d’équipe ;
•  Vous pouvez avoir n’importe quelle nationalité, mais vous ne devez pas avoir résidé ou exercé votre activité principale (travail, études, etc.) en France pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant immédiatement votre nomination (les courts séjours tels que les vacances ne sont pas pris en compte).

Diplômes souhaitables :

•  Expérience en génomique fonctionnelle et approches associées (ex. Crispr/Cas9, microscopie à feuille de lumière, Transcriptomique) ;
•  Formation scientifique en biologie régénérative ;
•  Expérience dans les soins et l’expérimentation d’animaux (invertébrés marins) ;
•  Expérience en bio-informatique.

Les candidats doivent soumettre une lettre de motivation et un CV.